مهندسی پزشکی از رشته های تخصصی تلفیقی علوم پایه، مهندسی و پزشکی است که مسئولیت پیاده سازی تکنولوژی پزشکی و بهینه سازی خدمات بهداشتی و درمانی منطبق بر اصولی علمی نوین دارد. نقش بین المللی تعریف شده برای مهندسی پزشکی شامل آموزش و نظارت و همکاری با مسئولین قانونی و بازرسین مراکز درمانی- آموزشی، بیمارستان های دولتی و دادن مشاوره‌ی فنی می باشد. فارغ التحصیلان این رشته همچنین براساس تجربه‌های خود به تولیدکنندگان وسایل پزشکی در زمینه بهبود طراحی‌های آتی مشاوره داده و به عنوان ناظر بر پیشرفت قسمت‌های فنی بیمارستا‌ن‌ها وخرید تجهیزات پزشکی نظارت کرده و آن ها را با توجه به بخش تولید راهنمایی می‌کنند. گروه مهندسی پزشکی در سال 1391 در دانشکده علوم نوین پایه گذاری شد و هم اکنون در زمینه های پژوهشی متنوعی مشغول به فعالیت است که از جمله آنها به موارد زیر می توان اشاره کرد:
پردازش سیگنالهای حیاتی
پردازش تصاویر پزشکی
مدل‌سازی سیستم‌های فیزیولوژیک
طراحی تجهیزات توان بخشی و کمک حرکتی
بررسی پدیده‌ی خواب و بیهوشی
ابزار دقیق پزشکی و ارتقاء تجهیزات پزشکی موجود
مطالعه بر روی کاربردهای لیزر در حوزه پزشکی
پردازش سیگنالهای ژنومیک
بیوانفورماتیک
مدیر گروه: دکتر فائقه گلابی معاون آموزشی گروه: دکتر ناصر صمد زاده اقدم معاون پژوهشی گروه: دکتر عطاالله جدیری شیخ‌زاده